不当的保存方法会影响咖啡的品质和风味。一般来说，开封后的咖啡存放期-咖啡豆为四周，咖啡粉略短。真空包装的咖啡豆如未拆封则可长达四个月。欲使咖啡的物理和化学变化达到最小，贮存的包装是一门很大的学问。购买回家的咖啡豆要存放在密封的容器内，可放入冰箱内冷藏，记得在贮存咖啡的桶中洒一小的盐(不要将包装咖啡的袋子拆掉以免咖啡和盐混合使咖啡尝起来有咸味)，有助于保存咖啡的香味。
购买时最好选择一种透气袋在密封的包装上多一个单向透气孔(圣朵斯咖啡)，好让豆子或咖啡粉的气体能排的出来，但外面的空气却进不去。由于咖啡粉的保存期限较咖啡豆短，如在冲煮咖啡前才
研磨有助于确保咖啡豆的新鲜度及维持咖啡的香味。
